Zlecenie 7089276 - Zapytanie ofertowe w sprawie usługi wykonania badań...

anych testów qPCR w ramach projektu „Mobilny analizator genetyczny do detekcji patogenów roślin uprawnych” planowanego do realizacji w ramach poddziałania 1.1.1 „Badania przemysłowe i prace rozwojowe realizowane przez przedsiębiorstwa” Programu Operacyjnego Inteligentny Rozwój, lata 2014-2020.

Projekt dotyczy prac B+R oraz prac rozwojowych, które mają doprowadzić do opracowania i komercjalizacji innowacyjnej w skali międzynarodowej, mobilnej aparatury diagnostycznej do wykrywania wybranych 16 patogenów roślin uprawnych, opartej na technologii Real-time PCR, w opcji multipleksowej (umożliwiającej jednoczesne wykrywanie do 4 patogenów).

Przedmiotem zamówienia jest usługa wykonania badań porównawczych parametrów diagnostycznych systemu Terrabio wobec obecnie stosowanych testów qPCR. Cel zamówienia Przedmiotem zamówienia jest usługa wykonania badań porównawczych parametrów diagnostycznych systemu Terrabio wobec obecnie stosowanych testów qPCR. Przedmiot zamówienia Metodyka badań: metodyka wykrywania kluczowych patogenów grzybicznych opracowana w oparciu o techniki biologii molekularnej: reakcję łańcuchową polimerazy (PCR), ilościową reakcję łańcuchową polimeraz (qPCR / Real-Time PCR). W badaniach zostanie wykorzystana podstawowa metodyka reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) obejmująca amplifikację docelową in vitro genów z wcześniej wyizolowanego DNA. Ponadto modyfikacja metody, umożliwiająca obserwację wyników amplifikacji w czasie rzeczywistym a kwantyfikacja materiału genetycznego w próbce jest przynajmniej półilościowa (qPCR). Badania muszą być wykonane zwalidowanymi zestawami testowymi wykorzystywanymi do rutynowej diagnostyki lub też zamawiający musi przedstawić charakterystykę diagnostyczną wykorzystywanych testów określającą m.in. czułość, specyficzność, limit detekcji (w kopiach genomu patogenu na jednostkę miary), wewnątrz-seryjne i między-seryjne odchylenie standardowe wyników pomiaru.

Badania te obejmować będą 800 analiz jako iloczyn badanych prób (50) oraz ilości patogenów do wykrycia w próbach biologicznych (16 patogenów: Blumeria graminis, Puccinia recondita, Septoria tritici, Septoria nodorum, Rhynchosporium secalis, Pyrenophora teres, Puccinia coronata, Sclerotinia sclerotiorum, Alternaria brassicae, Phoma lingam, Botrytis cinerea, Plasmodiophora brassicae, Helminthosporium turcicum, Aureobasidium zeae,Cercospora beticola, Phytophthora infestans) oraz uwzględnia wykonanie podwójnych oznaczeń. Liczba ta nie zawiera ewentualnych kontroli procesu diagnostycznego, które powinny zostać wykonane zgodnie z zasadami Dobrej Praktyki Laboratoryjnej. Wykonawca zobowiązuje się do wyizolowania materiału genetycznego techniką komercyjną o potwierdzonej skuteczności lub jeśli taka technika nie jest dostępna powinien przedstawić odpowiednie uzasadnienie wyboru innej skutecznej metody izolacji kwasów nukleinowych. Próbki środowiskowe będą pobrane w sposób identyczny z procedurą Terrabio (Blumeria graminis - liście rdza brunatna; Puccinia recondita - liście; Septoria tritici - liście; Septoria nodorum - liście, kłos; Rhynchosporium secalis - liście; Pyrenophora teres- liście, ziarniak; Puccinia coronata - liście; Sclerotinia sclerotiorum - gleba, liście; Alternaria brassicae - liście; Phoma lingam - liście, nasiona; Botrytis cinerea - gleba, liście; Plasmodiophora brassicae - gleba, korzeń, liście; Helminthosporium turcicum - gleba; Aureobasidium zeae - gleba, liście; Cercospora beticola - gleba, liście; Phytophthora infestans - gleba, liście, bulwy, łodyga. Część pobranej próbki biologicznej analizowana będzie w sposób zgodny z procedurą analizy opracowaną przez Terrabio.

Wykonawca zobowiązuje się do dostarczenia niezbędnych odczynników, materiałów zużywalnych oraz sprzętu służących do izolacji materiału genetycznego, przygotowania, przeprowadzenia i analizy wyników reakcji RealTime-PCR.

Zamawiający zobowiązuje się do dostarczenia wymaganej liczby próbek biologicznych oraz przynajmniej dwóch (2) analizatorów Terrabio z kompletem odczynników umożliwiających wykonanie analiz.

Własność wszelkich wykonanych w ramach zamówienia wyników badań i analiz oraz dokumentacji przeniesiona zostanie na Zamawiającego. W ramach realizacji zamówienia Wykonawca przeniesie na Zamawiającego (w zakresie nieograniczonym czasowo i terytorialnie):
(a) całość majątkowych praw autorskich, przy możliwie szerokim oznaczeniu pól eksploatacji;
(b) całość praw własności przemysłowej dotyczących wyników badań i analiz, dokumentacji oraz innych rezultatów realizacji Zamówienia.